新番《某科学的一方通行》第一集只是为剧情做好了铺垫，在第二集中正式的剧情才开始。死灵术士埃斯特小妹登场，学园都市隐藏的异端分子曝光，一方通行也终于开始了终极的个人秀，将与埃斯特小妹一起捣毁学园都市的黑暗，顺便拯救下世界哦。
死灵术师埃斯特小妹
本集登场的新角色埃斯特小妹是一位死灵术师，死灵术是一种魔法，能够利用脑内的残留思念当关键字，让虚假的魂魄侵入死者的肉体。至于埃斯特遭到警卫队的追捕，东躲西藏的也要找到最后之作，是因为她被骗入一个研究小组，后因为某种原因，埃斯特决定阻止实验计划的进行，她前往医院是为了找到最后之作。
说来埃斯特不幸又很幸运，她在医院中没有找到最后制作，但却发现了一方通行。不过此时一方通行早早的就因外面杂乱的声音，而关掉了自身周围的声音，看着手中的小说。埃斯特被虚假的警备队员电晕，并羞耻的捆起来，都没能让一方通行发现。
一方通行他在狂笑
直到捆绑着的埃斯特要被DA成员惩罚的时候，一方通行发现埃斯特掉落的，最后之作的照片。继而满是疑惑的一方通行阻止了DA成员的离开。心态爆炸的DA成员疯狂的自曝，并放出了寄存灵魂尸体的特殊兵器“棺材”。
这兵器非常厉害，可以大幅度增强体内尸体素材的能力。比如第二集开始，出现的自杀未遂又被DA淹死的人皮挟美，她只是等级二的发火能力者，但被这兵器增幅后，就有了等级四的实力。DA队员非常看好这个兵器，认为这兵器能够打败一方通行。
这种不入流的东西怎能入一方通行的法眼，只见一方通行一边狂笑，一边就轻松解决了这特殊的兵器。不过兵器中掉落的尸体把一方通行吓了一跳，这种情形让一方通行想起了御坂妹妹的事情，一方通行也在心痛，也在深刻的反思呢。
本集最后被一方通行间接救了的埃斯特小妹，决定把实情告诉一方通行，希望一方通行与自己共同保护世界。一方通行先是显示出了自己恶党的一面，把埃斯特小妹用能力捆绑了起来。而后在知道最后之作有危险后，一方通行做出了非常简单又直接的决定，那就是在埃斯特的指引下直捣老巢。话说，埃斯特小妹连续两次被捆绑，表情还那么享受，到底为啥啊？