为了做到萝卜周年供应，调剂蔬菜品种，满足城乡人民生活需要，除发展保护地生产新鲜蔬菜外，还要搞好蔬菜的贮藏保鲜，尤其我国北方地区，搞好秋萝卜的贮藏对保障冬春季节的市场供应非常重要。秋萝卜耐贮藏，一般能贮藏到第二年的3～4月。目前秋萝卜的贮藏法很多，如常用的埋藏（也称挖沟埋藏法）、窖藏（地下式）及大型冷库贮藏等。但是我国北方地区的个体户及专业户，多采用民间传统的埋藏法贮藏秋萝卜。其优点是经济简便，不需任何建筑材料。同时，管理技术易掌握。还有最重要一点就是埋藏法适合秋萝卜对贮藏环境的要求。冬季萝卜在贮藏过程中，都常会发生糠心和腐烂。在冬季萝卜的贮藏中防糠防烂，主要应掌握以下几点：
一、适时收获
萝卜的收获时间应根据具体天气情况而定，一般在10月中、下旬为宜。收获过早，萝卜长不开，个小质硬；收获过晚，生育期长，萝卜容易糠心。
二、选择优良品种
贮藏的萝卜以皮厚、质脆、含糖和水分多的晚熟品种为主。地上部比地下部长的品种以及选育的杂种一代耐贮性较好的品种，如心里美、石坝河甜萝卜、青皮萝卜等。此外，青皮种比红皮种及白皮种耐贮藏。肉质根紧密的小型品种不易糠心。同时，还要选无病虫为害、不冻、不破、不抽苔的萝卜。在寒露前后把萝卜拔出来，拧掉缨子，最好不用刀削顶，避免造成伤疤。如果窑温和气温尚高，可把选好的萝卜在田间和窑旁边埋起来，覆盖6～15cm的土，暂贮一段时间，以防止风吹日晒失水和遭受冻害，待天气冷后再入窖。
三、萝卜的贮藏原理
秋萝卜收获后，没有明显的生理休眠期。由于切断了其养分的供应来源，只能利用组织细胞内部贮存的营养物质进行生命活动，主要表现为分解作用—呼吸作用，即在氧气的参加下，将肉质根内的碳水化合物（糖类）等有机化合物分解成二氧化碳和水，同时释放出能量。所以，萝卜的呼吸作用愈强，衰老愈快，萝卜的品质变劣也越快。在萝卜贮藏期间，必须降低萝卜的呼吸作用。在贮藏萝卜时，要改善贮藏的环境条件，使萝卜的呼吸减慢（或强度降低），延长贮藏时间，同时还要避免缺氧而出现无氧呼吸。影响萝卜呼吸的因素主要是温度，因为呼吸作用是生物化学反应，对温度很敏感，在一定温度范围内，温度越高则呼吸作用越强，生物化学反应进行的快。因而，在低温条件下，能抑制它的生理活性，控制萌芽生长，使萝卜处于被迫休眠状态。萝卜贮藏的适萝卜贮藏期间，必须降低萝卜的呼吸作用。但还要防止因缺氧而出现的无氧呼吸，无氧呼吸生成的产物对萝卜有害。无氧呼吸的最终产物是酒精和二氧化碳，酒精在萝卜体内积累过多，能导致生物体细胞中毒而死亡，使贮藏萝卜腐烂败坏。
因此，在贮藏萝卜时，要改善贮藏的环境条件，使萝卜的呼吸减慢（或强度降低），延长贮藏时间，同时还要避免缺氧而出现无氧呼吸。影响萝卜呼吸的因素主要是温度，因为呼吸作用是生物化学反应，对温度很敏感，在一定温度范围内，温度越高则呼吸作用越强，生物化学反应进行的快。因而，在低温条件下，能抑制它的生理活性，控制萌芽生长，使萝卜处于被迫休眠状态。萝卜贮藏的适宜温度是1～3℃。在不引起生理损害的情况下尽可能降低温度来抑制萝卜的呼吸，把呼吸强度降到最低程度。萝卜贮藏过程中的水分变化直接影响贮藏效果。肉质根含水量在90%以上，在贮藏过程中，其含水量逐步降低，重量不断减轻。失水过多，会发生萎蔫现象，造成糠心，萝卜的品质及重量下降，正常的生理活动受到干扰，抗病能力减弱。贮藏环境的空气相对湿度90%～95%对萝卜有利，空气流速越快，则水分蒸发越多。
四、贮藏方法
1.室外窖贮
萝卜需要在外界气温降到-5℃以下，窖温在3℃～4℃时入窖为宜。霜降前入窖。入窖的萝卜要进行筛选，选好后抠净萝卜顶或用刀把顶削掉。但削顶一定要适度，否则顶芽易萌发，引起腐烂。窖贮一般不用埋土，防止生根。窖内要立支柱，挡成格，把萝卜一个挨一个地堆成约1m高的垛，上覆一薄层细沙，以保持萝卜的水分。不要堆得太高，否则易伤热。入窖时一定要轻拿轻放，决不能摔裂或碰破皮，否则易引起水分蒸发和感染病菌。窖内温度要控制在1℃～3℃之间，相对湿度85%～90%为宜。入窖后2个月倒一遍堆，剔除烂、病萝卜，并除掉顶部芽子。把上边萝卜倒到下边，一般整个贮存期倒两遍即可。 立冬前后，由于温度急剧下降，要防止冻害。要根据天气和窖温情况，注意窖门的启闭。天气寒冷时，用草帘或谷草将窖封严，防止疾风侵入窖内。立春后，气温逐渐回暖，白天把门关严，防止暖风进入窖内，以免引起发芽和腐烂。此时窖内易干燥，湿度小，应往堆上喷水，防止糠心，保证萝卜品质。
2.混合液处理
萝卜糠心是一种由于营养物质供应不足而呈现出的饥饿衰老现象，特别是早播、生长快的大型萝卜更为严重。采用50～100ppm萘乙酸、0.5%蔗糖和5ppm硼砂的混合液处理。
3.塑料袋贮
根据贮存萝卜的数量购置塑料袋，要求不透气，大小适中，以每袋装5～10kg为宜。把选好的萝卜放入塑料袋内扎紧袋口，最好扎完一道后卷回来再扎一道，然后放在室内如厨房一角即可。食用时，取出要用的萝卜后，仍将塑料袋扎好。在贮存过程中注意不要碰坏塑料袋。
4.室内埋贮
埋贮室内如果是土地面，可在墙角处挖一贮藏坑，坑大小根据存贮量多少而定，一层萝卜覆一层土，一般4~5层，最上边覆盖15~20cm的湿土。