1、大部分员工长期工资3500元以下，没有将所有员工输入个税扣除系统，退休员工没有及时进行非正式处理，仍然继续申报个人所得税，报税工资低于实发工资，隐瞒个人所得税。

2.一般承包企业、分包企业派驻跨省外地工程项目的管理人员、技术人员和其他工作人员在外地工作期间的工资、工资收入个人所得税，一般承包企业、分包企业未依法向工程作业所在地税务机关代扣代缴税款。通过劳务派遣公司雇佣劳动人员，录用跨省工作期间的工资、工资收入个人所得税，劳务派遣公司未依法代缴，未向工程所在地税务机关申报缴纳。

3.员工在两处以上领取工资和工资的，应当向其中一处所在地主管税务机关申报，企业没有按规定申报。个人投资者从投资企业(个人独资企业、合资企业除外)借钱，纳税年度结束后不返还，也不用于企业生产经营，未返还的贷款可视为企业对个人投资者的股息分配，不按“利息、股息、股息、股息、收入”项目征收个人所得税。

4、个人收入的形式，包括现金、实物、有价证券和其他形式的经济利益。收入是实物，应根据取得的凭证上规定的价格计算应纳税所得额。没有凭证的实物或凭证上标明的价格明显低，参照市场价格确定应纳税所得额。收入是有价证券，根据面值和市场价格确定应纳税所得额。收入是其他形式的经济利益，参照市长/市场价格确定应纳税所得额。

5.企业职员全年除一次性奖金外，还会获得各种名义奖金。比如发给员工的半年度奖、季度奖、加班奖、先进奖、出席奖等，不会与当月工资、工资收入合并，而是按照税法的规定扣缴个人所得税。

6、纳税申报系统升级后，验证状态为“验证失败”，意味着自然人身份信息与公安机关的居民身份证信息不一致。扣缴单位要确认问题，区分身份证号码填写错误或姓名填写错误进行更正。