农产品购买扣除是国家为了鼓励农业发展，销售农业生产者资产的农产品免征增值税的特殊事项，但增值税是循环扣除政策，有传导机制，国家对顶级初级农产品免税，不做政策上的特殊规定，最直接的结果是下游企业无法扣除购买税，无法缴纳更多增值税，从而整体沦为税负。因此，要想办法从政策上免除农业生产者的增值税，让下游企业充分扣除购置税。出现了我们看到的农产品收购发票和销售发票计算扣除以及小规模纳税人发行3%的特别票以9%扣除的特殊情况。

农产品证明书上通常有4种增值税专用发票。二、海关专用缴款书；3农产品销售发票；4农产品收购发票，后面的这两个属于普通发票。

这四种证件根据发行主体分为三种扣除方法。

第一：接收一般纳税人开具的增值税专用发票或海关专用捐款书，是对发票进行税收抵免。这很常见。

第二：从小规模纳税人手中购买农产品，收到了3%征收率的增值税专用发票，发票上显示的税额为3%，但从2019年4月1日开始以票面金额和9%的退税率计算抵扣进项税。

第三：从农业生产者购买农产品，收购发票和销售发票，以明码标价和9%的退税率计算进项税。

以下是两个例子

例1。某企业于2022年3月从小规模纳税人手中收购牛尾，获得以税务机关代替的增值税专用发票、面值1000、征收率3%、税额30、价格税合计1030元，可扣除的进项税额为90元，而不是1000*3%。

借用：原材料-牛尾940

缴纳税金-缴纳增值税(进项税)90

贷款：应付帐款1030

申报增值税时，请填写《增值税纳税申报表附列资料（二）》(现行购置税明细)第6栏“农产品收购发票或销售发票”一栏。买断1，金额1000，税额90。

例2。某企业从农户手中收购粮食，获得农产品销售发票1份，金额98784元，可扣除的进项税额为987849%=8890.56元。

借用：原材料-食品89893.44

纳税-增值税(进项税)8890.56

贷款：应付帐款98784

申报增值税时，请填写《增值税纳税申报表附列资料（二）》(现行购置税明细)第6栏“农产品收购发票或销售发票”一栏。买断1，金额98784，税额8890.56。

最后说：注意事项收购发票应当个人向农业生产者开具，不得向部分企业性质开具收购发票。另外，农产品收购发票不是你想收到的。首先，你公司确实在做农产品收购业务，还需要具备其他条件。申请批准后才能收购。否则，这种自行开票的行为很容易导致虚开发票的结果。