合作的方式多种多样，如合作设立公司、合作开发软件、合作购销产品等等，不同合作方式涉及到不同的项目内容，相应的协议条款可能大不相同。
本协议的条款设置建立在特定项目的基础上，仅供参考。实践中，需要根据双方实际的合作方式、项目内容、权利义务等，修改或重新拟定条款。 甲乙双方共同参与投标的___________工程施工合同（以下简称主合同），在双方共同努力下，业主将该合同授予甲方。经协商，甲乙双方就合作施工主合同工程施工事宜达成一致意见，以便共同遵守。
第一条：工程实施责任及要求
1、甲方将主合同项下全部工程的实施责任交乙方承担（包括该合同项下的全部变更工程）。
2、工期、质量必须满足主合同或业主要求。
第二条：甲方责任风险提示：
应明确约定合作各方的权利义务，以免在项目实际经营中出现扯皮的情形。
再次温馨提示：因合作方式、项目内容不一致，各方的权利义务条款也不一致，应根据实际情况进行拟定。
1、负责及时办理主合同的履约担保和动员预付款担保手续。
2、负责为乙方实施主合同提供相应的授权，解决只能由甲方解决的事项。
3、负责及时向乙方传递来自业主、监理、沿线地方政府的涉及本协议执行的指令、通知、图纸、资料等。
4、负责在乙方所做计量支付申报工作上，及时办理需要自身完成的工作。
5、负责工程质量、进度、文明施工、安全生产、环境保护、计量支付等方面的监督检查。
第三条：乙方责任
1、负责代甲方履行主合同的施工、缺陷修复及保修责任。
2、负责以自身资源按照主合同要求完成该工程，自担风险、自负盈亏。
3、自觉接受甲方、业主、监理的各项监督检查。
4、负责自本协议签字之日起____日内，向甲方交纳：甲方为办理主合同保函而向银行交纳的抵押金______元及相应的财务费______元。
5、负责自本协议签字之日起____日内，向甲方交纳：本协议履约保证金______元。
6、保证不以甲方或项目部的名义从事于本工程无关的活动。
7、未经甲方许可，不得将本工程的全部或任何部分转包或分包给
第三方。
8、负责及时清偿为实施本工程而产生的各类债务，及时支付民工工资。
9、每月____日前向甲方报送当月统计报表及下月进度计划。业主计量支付报表批复后____日内传至甲方。
10、工程结束后，除向业主提交完整的竣工资料外，还需向甲方提交业主终期支付报表，交工证书、施工总结等。1
1、负责为甲方派遣到本工程从事本工程管理、或解决需由甲方出面解决的问题的人员提供必要的工作和生活条件。
第四条：印章管理项目经理部印鉴由甲方授权代表管理，用印范围只对业主和监理以及当地政府的各种报表、文件、资料、证明、工程结算及费用拨付等。因乙方组织施工所需的劳务合同、机械设备购置和租赁合同、各种材料采购和加工合同、临时征地合同等确实需要使用项目经理部名称和印鉴时，须经甲方代表同意，用印人必须是乙方或乙方授权代表。
第五条：费用、结算与支付
1、业主支付给本工程的动员预付款、材料预付款、工程结算款、奖金一律归乙方所有，相应的罚金亦由乙方承担。
2、甲方收取管理费为主合同总价的______%（含变更、索赔费用）。施工过程收取的费用以乙方当月统计产值为基数进行计算，最终收取管理费总额以业主终期计量支付工程款为基数进行计算。乙方应在每月____日前将本月管理费汇至甲方指定账户。
3、甲方收到银行保函抵押金后____日内支付乙方。
4、业主履行了工程缺陷修复责任的前提下，甲方收到业主返还的质量保证金后____日内支付乙方。
5、乙方负责承担本工程所发生的各种税赋，并按有关规定纳税。